阜阳医药管理学校是全省唯一的一所医药职业中等专业学校。1997年经阜阳市教委、市编委批准成立。该校位于阜阳市经济技术开发区，占地面积18亩，主管部门医药管理局。

1998年学校开始独立招生，1999年学校同安徽医科大学成人教育学院联合开办“安徽医科大学成人教育学院阜阳教学点”；2001年经市劳动局批准报省劳动厅备案成立“阜阳市医药行业职业技能鉴定站”；该校的前身是“安徽省医药干部学校阜阳分校”。

近年来，学校先后为各县（市）培训医药行业在岗职工3000多人，有2000多人取得职业资格证书，1000多人取得岗位培训结业证书。受原省医药管理局委托，学校对30多名市属单位药师进行了继续教育，经考试合格取得继续教育合格证书。