皖南医药卫生学校由原芜湖地区卫生学校更名而来，始建于1973年，是安徽省以口腔、护理专业为特色的国家普通中等专业学校。2008年8月经市政府批准，芜湖地区卫校与宣城职业技术学院合并，保留芜湖地区卫校整体建制。

2010年宣城职业技术学院以芜湖地区卫校为基础设置护理系，2016年9月，芜湖地区卫校搬迁至宣城职业技术学院校区，2017年5月经市政府批准，“芜湖地区卫生学校”正式更名为“皖南医药卫生学校”。

目前宣城职业技术学院护理系现设有护理、助产、口腔医学技术3个专业，计3500余人；皖南医药卫生学校现设有护理、口腔修复工艺2个专业，在广德、宁国、宣州区设立了3个教学点，共有学生920余人，其中本校学生294人。

附属口腔医院为二级口腔医疗机构，现有医护人员33人，内设科室7个，椅位22张，床位16张，租用场地位于芜湖市康复路，建筑面积约1280平方米。

2017年8月，经市政府批准，皖南医药卫生学校新校区选址位于圣俞路与桂花路交叉口西南角，宣城职业技术学院建成区东北侧，规划用地面积约34.78公顷。皖南医药卫生学校全面贯彻党的教育卫生工作方针，坚持“德育为首、教学为主、育人为本、就业为先”的办学宗旨，严谨治校、科学管理，注重学生德智体美全面和谐发展，在省内外享有较高的知名度和良好声誉。